自2024年起，韩国企划预算处与科学技术信息通信部将常态化运营研究开发（R&D）预算协商会。此举旨在通过扩大双方在R&D预算分配与调整过程中的参与，提高专业性与财政效率。此前，两部门间的沟通主要依赖于非正式的实务层面讨论，难以对关键议题进行系统性协商。为此，双方将每月定期召开局长级常设协商会，广泛讨论政府R&D投资方向、支出效率化方案及新项目审查等议题。
2024年韩国R&D总预算为35.5万亿韩元，其中85.3%（30.5万亿韩元）为主要R&D预算，由科学技术创新本部优先制定分配与调整方案，企划预算处则最终编制预算。今后，国家科学技术咨询会议下属专家委员会将对各部门提交的R&D项目进行深入审查，企划预算处也将参与其中。此外，在预算编制过程中，科学技术创新本部的意见将通过常设协商会的事前讨论得到充分反映。
两部门决定在R&D预算编制过程中加强事前协商与共同审查。对于重要事项，企划预算处副处长与科学技术创新本部长将进行副部长级协商，使合作关系更加制度化、稳定和可预测。此举旨在解决部门间职责分工导致预算编制程序碎片化的问题。
同时，R&D新项目管理体系也将得到改善。过去，部分部门和地方政府在科学技术创新本部审查阶段未提交的项目，会在企划预算处编制阶段提出。今后，原则上将限制此类新项目要求，只有在国家政策上极为重要或紧急的情况下才会例外。即使如此，也需经过咨询会议的深入审查，以进一步强化R&D投资的责任性与透明度。这些改进措施将从下一年度预算编制过程开始实施。