Cục Phát triển Nông thôn (Giám đốc Lee Seung-don) đã đưa ra các hướng dẫn về quản lý sau thu hoạch cho các loại cây thuốc nhằm đảm bảo chất lượng và an toàn của chúng, cũng như duy trì các thành phần dược lý một cách ổn định. Các thành phần dược lý của cây thuốc bắt đầu thay đổi ngay sau khi thu hoạch, vì vậy nên rửa, làm khô và phân loại chúng nhanh chóng.
Đối với việc rửa, nên sử dụng nước sạch và trong để loại bỏ tạp chất, nhưng thời gian rửa không nên quá lâu để tránh các thành phần hòa tan bị tan trong nước. Sau khi rửa, cần làm khô hoàn toàn cây thuốc để tránh sự phát triển của vi sinh vật trong môi trường ẩm ướt. Quá trình làm khô là rất quan trọng để xác định chất lượng của cây thuốc. Khi làm khô tự nhiên, cần đảm bảo luồng không khí đủ và tránh ánh nắng trực tiếp để ngăn ngừa sự suy giảm.
Khi sử dụng máy sấy, cần điều chỉnh nhiệt độ theo đặc điểm của cây thuốc, thường dưới 60°C. Ví dụ, nhiệt độ thích hợp để làm khô mẫu đơn, chuông và hoàng kỳ là khoảng 40°C, trong khi đối với ngũ vị tử là 40-50°C và đối với bạch truật là khoảng 50°C. Nếu không thể làm khô ngay lập tức, nên lưu trữ tạm thời ở nơi thông thoáng và tránh mưa.
Đối với việc lưu trữ, nên sử dụng vật liệu đóng gói sạch và an toàn, và thêm chất hút ẩm như gel silica để ngăn ngừa độ ẩm và sự suy giảm. Các loại cây có hàm lượng nước cao như địa hoàng, táo, kỷ tử và ngũ vị tử cần được lưu trữ cẩn thận do sự phát sinh nhiệt. Cần thông gió thường xuyên các kho lưu trữ để tránh hoạt động của vi sinh vật gây thối rữa. Ngoài ra, cây thuốc nên được lưu trữ ở nhiệt độ thấp để kéo dài thời gian bảo quản và giảm thiểu nguy cơ sâu bệnh.