สำนักงานพัฒนาการเกษตรชนบท (RDA) ได้แนะนำวิธีการจัดการหลังการเก็บเกี่ยวสำหรับพืชสมุนไพร เพื่อรักษาคุณภาพและความปลอดภัยของพืชสมุนไพร และรักษาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาให้คงที่.
สารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาของพืชสมุนไพรจะเปลี่ยนแปลงทันทีหลังการเก็บเกี่ยว ดังนั้นควรล้างและทำให้แห้งโดยเร็วที่สุด. การล้างควรใช้เวลาสั้นๆ และใช้น้ำสะอาดเพื่อป้องกันการละลายของสารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาในน้ำ. หลังจากล้างแล้ว ควรทำให้แห้งเพื่อป้องกันการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ในสภาพแวดล้อมที่ชื้น.
การทำให้แห้งเป็นกระบวนการสำคัญที่กำหนดคุณภาพของพืชสมุนไพร. ควรตรวจสอบให้แน่ใจว่ามีการไหลเวียนของอากาศที่ดีเมื่อทำให้แห้งตามธรรมชาติ และควรระวังไม่ให้พืชสมุนไพรเสื่อมสภาพในที่ร่มหรือแสงแดด. เมื่อใช้เครื่องอบแห้ง ควรรักษาอุณหภูมิให้เหมาะสมกับลักษณะของพืชสมุนไพร (ส่วนใหญ่ไม่เกิน 60°C).
การเก็บรักษาควรใช้วัสดุบรรจุภัณฑ์ที่สะอาดและปลอดภัย และใส่สารดูดความชื้นเพื่อป้องกันความชื้นและการเสื่อมสภาพ. ควรระบายอากาศในคลังเก็บบ่อยๆ เพื่อป้องกันการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ที่ทำให้เกิดการเน่าเสีย. พืชสมุนไพรบางชนิดต้องระวังเป็นพิเศษในการเก็บรักษาเพื่อป้องกันการเกิดแมลง.